MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Meiothermus ruber DSM 1279 genome

Total Repeats: 68571

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
68501	NC_021081	AGGC	2	8	3096025	3096032	25 %	0 %	50 %	25 %	482884684
68502	NC_021081	TTC	2	6	3096039	3096044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884684
68503	NC_021081	TGA	2	6	3096074	3096079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884684
68504	NC_021081	TTC	2	6	3096081	3096086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884684
68505	NC_021081	TAG	2	6	3096115	3096120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68506	NC_021081	CCT	2	6	3096123	3096128	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68507	NC_021081	TGGG	2	8	3096141	3096148	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
68508	NC_021081	CAGGGC	2	12	3096191	3096202	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
68509	NC_021081	GAG	2	6	3096212	3096217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68510	NC_021081	CCCACC	2	12	3096225	3096236	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
68511	NC_021081	TGC	3	9	3096278	3096286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68512	NC_021081	ACCAG	2	10	3096338	3096347	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
68513	NC_021081	CCT	2	6	3096408	3096413	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482884685
68514	NC_021081	CTG	2	6	3096503	3096508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482884685
68515	NC_021081	CCT	2	6	3096523	3096528	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482884685
68516	NC_021081	TTC	2	6	3096548	3096553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884685
68517	NC_021081	AAAGG	2	10	3096554	3096563	60 %	0 %	40 %	0 %	482884685
68518	NC_021081	CAC	2	6	3096596	3096601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482884685
68519	NC_021081	CAGC	2	8	3096632	3096639	25 %	0 %	25 %	50 %	482884685
68520	NC_021081	GAT	2	6	3096656	3096661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884685
68521	NC_021081	TTA	2	6	3096739	3096744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68522	NC_021081	AGC	2	6	3096768	3096773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68523	NC_021081	AGTC	2	8	3096805	3096812	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
68524	NC_021081	CAAG	2	8	3096870	3096877	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
68525	NC_021081	CCG	2	6	3096907	3096912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68526	NC_021081	C	6	6	3096920	3096925	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
68527	NC_021081	GCC	2	6	3096939	3096944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68528	NC_021081	CAAG	2	8	3097047	3097054	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
68529	NC_021081	TTTC	2	8	3097062	3097069	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
68530	NC_021081	CCG	2	6	3097087	3097092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68531	NC_021081	C	6	6	3097100	3097105	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
68532	NC_021081	CAG	2	6	3097201	3097206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68533	NC_021081	AGT	2	6	3097220	3097225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68534	NC_021081	GTT	2	6	3097234	3097239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68535	NC_021081	GGT	3	9	3097248	3097256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68536	NC_021081	CCA	2	6	3097319	3097324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68537	NC_021081	GCG	2	6	3097353	3097358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482884686
68538	NC_021081	GGC	2	6	3097365	3097370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482884686
68539	NC_021081	CCG	2	6	3097433	3097438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482884686
68540	NC_021081	CGT	2	6	3097464	3097469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482884686
68541	NC_021081	AGCCGG	2	12	3097473	3097484	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	482884686
68542	NC_021081	GCT	2	6	3097485	3097490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482884686
68543	NC_021081	TGC	2	6	3097493	3097498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482884686
68544	NC_021081	GGTC	2	8	3097518	3097525	0 %	25 %	50 %	25 %	482884686
68545	NC_021081	GCAA	2	8	3097583	3097590	50 %	0 %	25 %	25 %	482884686
68546	NC_021081	CTT	2	6	3097621	3097626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884687
68547	NC_021081	T	6	6	3097625	3097630	0 %	100 %	0 %	0 %	482884687
68548	NC_021081	CCTGGC	2	12	3097631	3097642	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	482884687
68549	NC_021081	CCA	2	6	3097750	3097755	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482884687
68550	NC_021081	CGG	2	6	3097829	3097834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482884688
68551	NC_021081	GTT	2	6	3097840	3097845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482884688
68552	NC_021081	CTG	2	6	3097849	3097854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482884688
68553	NC_021081	CTT	2	6	3097860	3097865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884688
68554	NC_021081	CCT	2	6	3097881	3097886	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482884688
68555	NC_021081	GGC	2	6	3097921	3097926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482884688
68556	NC_021081	CTT	2	6	3097983	3097988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884688
68557	NC_021081	T	6	6	3097987	3097992	0 %	100 %	0 %	0 %	482884688
68558	NC_021081	GCT	2	6	3098004	3098009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482884688
68559	NC_021081	TGGT	2	8	3098060	3098067	0 %	50 %	50 %	0 %	482884688
68560	NC_021081	CCA	2	6	3098086	3098091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482884688
68561	NC_021081	T	7	7	3098198	3098204	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68562	NC_021081	GTGG	2	8	3098301	3098308	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
68563	NC_021081	GGC	2	6	3098381	3098386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
68564	NC_021081	GGCCT	2	10	3098490	3098499	0 %	20 %	40 %	40 %	482884689
68565	NC_021081	GTA	2	6	3098520	3098525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884689
68566	NC_021081	TCC	2	6	3098545	3098550	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482884689
68567	NC_021081	TCC	2	6	3098590	3098595	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482884689
68568	NC_021081	CCA	2	6	3098633	3098638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482884689
68569	NC_021081	C	6	6	3098722	3098727	0 %	0 %	0 %	100 %	482884689
68570	NC_021081	GCA	2	6	3098772	3098777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68571	NC_021081	N	100	100	3098782	3098881	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.